水利部到北京汽车博物馆可以选择以下几种交通方式：
1. 公共交通：
地铁：可以乘坐地铁10号线，在“北土城站”下车，然后换乘地铁8号线，在“奥林匹克公园站”下车，从D口出站，步行至北京汽车博物馆。
公交：可以选择乘坐645路、628路、609路等公交车，到达北京汽车博物馆站下车。
2. 出租车或网约车：
直接叫一辆出租车或使用网约车软件，如滴滴出行等，直接从水利部出发到北京汽车博物馆。
3. 自驾：
如果选择自驾，可以导航至北京汽车博物馆，根据实际路况选择合适的路线。
以上几种方式都可以方便快捷地到达北京汽车博物馆。根据个人情况和当天交通状况，选择最适合自己的交通方式。
