日本三年多次和五年多次签证是针对不同类型的外国游客的长期多次入境签证，它们之间主要有以下区别：
1. 有效期：
三年多次签证：允许持证人三年内多次入境日本。
五年多次签证：允许持证人五年内多次入境日本。
2. 停留期限：
两种签证的具体停留期限可能因申请人的资格和目的而有所不同，但通常情况下，五年多次签证的每次停留时间可能会更长。
3. 申请条件：
三年多次签证：通常针对的是有稳定收入、良好信用记录的个人或家庭。
五年多次签证：申请条件更为严格，通常要求申请人有较高的经济实力和良好的信誉，或者与日本有较为紧密的商务、学术或家庭关系。
4. 费用：
五年多次签证的申请费用通常高于三年多次签证。
5. 入境次数：
两种签证都允许多次入境，但具体次数可能有所不同，需要根据申请人的具体情况来确定。
6. 审批难度：
五年多次签证的审批可能更为严格，因为其有效期更长，对申请人的要求更高。
在选择申请哪种签证时，建议根据个人的实际情况和需求来决定，同时也要考虑到签证的有效期、停留期限和申请条件等因素。
